BIOCHIMIE: Microbiologie

• Contribution au profil d'enseignement

• Communiquer et informer

  Utiliser le vocabulaire adéquat

  Maîtriser les concepts scientifiques

  Utiliser à bon escient le vocabulaire des domaines Appliquer les connaissances des sciences fondamentales Evaluer la signification et les conséquences des opérations effectuées

  Appréhender les méthodes d’analyse des constituants du vivant

  Appliquer les méthodes de l’enzymologie et de l’immunologie Identifier et dénombrer des populations de micro-organismes d’intérêt industriel, médical et environnemental

• Acquis d'apprentissage spécifiques sanctionnés par l'évaluation

Décrire des exemples d’applications utiles pour l’homme en relation avec les différents métabolismes décrits et schématiser leur mise en oeuvre (exemples en agro-alimentaire, dans la production de métabolites, dans la gestion de déchets).

Décrire et classifier les diverses stratégies déployées par les microorganismes pour coloniser et occuper d'une manière stable une multitude de niches écologiques, en particulier les différents modes d’associations impliqués.

Illustrer les modes d’associations par des exemples concrets, les comparer et décrire les échanges impliqués. Modéliser un écosystème en y intégrant les diverses voies métaboliques et les associations microbiennes

Citer des exemples de microorganismes pathogènes pour l’homme et les mettre en relation avec les facteurs de virulence, les mécanismes d’infection, les toxines, les méthodes de lutte et les moyens de préventions adéquats.

Etablir un protocole pour identifier des microorganismes, en particulier les microorganismes pathogènes, ceux qui concernent la sécurité alimentaire et les microorganismes utilisés lors de productions.

Illustrer les relations existant entre les antigènes, les récepteurs d’antigènes, les molécules du CMH et les molécules de co-stimulation.

Schématiser diverses voies de signalisation cellulaire mises en place lors d’une activation du système immunitaire.

Expliquer les principes des techniques d’analyses immunologiques et contextualiser leur utilisation sur base d’exemples.

Etablir des bilans chimiques et énergétiques des principaux métabolismes microbiens (fermentations, respirations, photosynthèses), identifier ceux-ci sur base des principaux substrats, produits et enzymes et y associer les microorganismes principaux

Reconnaître et identifier les principaux métabolismes microbiens mis en oeuvre par les microorganismes dans leur environnement naturel

identifier et décrire les principaux types d’associations symbiotiques (commensalisme, mutualisme, parasitisme) ou non (antagonisme, prédation)

• Objectifs

• Microbiologie

  Le cours de 2° année sera axé sur le métabolisme microbien en vue de développer les techniques classiques de détection des microorganismes couramment recherchés dans les contrôles qualités et d’étudier les microorganismes importants en agro-alimentaire ou dans les entreprises pharmaceutiques. Dans le cadre de l’étude du métabolisme, les productions microbiennes classiques (fermentations alcooliques, lactiques, …, production d’acides aminés, d’antibiotiques,…) seront détaillées.

  Les relations entre les microorganismes et leur environnement seront également étudiées. Les diverses associations microbiennes seront passées en revue. La nature des différents types d'associations dans le monde microbien et leur intégration dans l'écologie microbienne serviront de base à l'approche des mécanismes impliqués dans les maladies infectieuses.

  Immunologie

  Dans un premier temps, l’étudiant devra être capable de comprendre et d’illustrer la communication cellulaire du système immunitaire et les différentes molécules impliquées. Ensuite, il aura pour but de cerner les principes de nombreuses techniques immunologiques et de déterminer l’analyse immunologique la plus adéquate au problème posé.

• Contenus

• Microbiologie

  1. Le monde microbien

  Composition, Propriétés,types nutritionnels, taxonomie phénétique et phylogénétique

  2. Métabolisme bactérien

     Généralités, oxydo-réduction, types nutritionnels

     Les fermentations, exemples, applications

     Les respirations aérobie et anaérobies, exemples, applications et rôle écologique

     Les photosynthèses, anoxygénique et oxygénique

  3. Ecologie microbienne

  Les associations microbiennes : Généralités, compétition, prédation, commensalisme, mutualisme, parasitisme

   Les écosystèmes microbiens : Quorum sensing, Associations plantes – microorganismes

   

  Immunologie

  1. Communication cellulaire du système immunitaire - Relation entre les antigènes, les récepteurs d’antigènes, les molécules du CMH et les molécules de co-stimulation - Signalisation cellulaire

  2. Techniques immunologiques : production d’anticorps, immunoprécipitation, réactions d’agglutination, dosages d’anticorps basés sur la liaison à des supports solides, immunohistochimie, immunofluorescence, cytométrie en flux.

• Méthodes d'enseignement et d'apprentissage

• Cours ex-cathedra
• Activités interactives demandant une participation active de l’étudiant

• Evaluation

• Immunologie

  Examen Oral

  Microbiologie

  Examen Oral

• Langue(s) de l'unité d'enseignement

• Français

• Supports de cours au format papier

• Horion Julie,

  "Immunologie "

• Autres supports de cours

• Partie de fiche comprenant des problèmes syntaxiques