BIOCHIMIE: Bioinformatique

• Contribution au profil d'enseignement

• Communiquer et informer

  Choisir et utiliser les moyens d’informations et de communication adaptés

  Collaborer à la conception, à l’amélioration et au développement de projets techniques

  Analyser une situation donnée sous ses aspects techniques et scientifiques

  S’engager dans une démarche de développement professionnel

  Développer une pensée critique

  Maîtriser les concepts scientifiques

  Utiliser à bon escient le vocabulaire des domaines

• Acquis d'apprentissage spécifiques sanctionnés par l'évaluation

- Rechercher un renseignement précis en exploitant les banques de données de bioinformatique en ligne sur le web (EMBL, NCBI, DDBJ, UniprotKB).

- Distinguer les notions d’identités, de substitutions conservatrices ou non conservatrices, de similarités, d’homologie, de gap et de score d’alignement (matrices PAM et BLOSUM).

- De différencier et de pratiquer au laboratoire les différents algorithmes utilisés pour la comparaison de séquences nucléiques et protéiques (Needleman et Wunsch, Smith et Waterman, notion de dot-plot).

- Prédire la fonction d’une protéine en utilisant les outils d’alignement mis à sa disposition sur le web (Programmes heuristiques, Fasta, Blast et variantes).

- Analyser une sortie de fichier d’un logiciel de bioinformatique et d’évaluer un jugement scientifique objectif.

- Expliquer la difficulté d’analyse des séquences protéiques et nucléiques.

• Objectifs

• Texte trop volumineux pour être consulté

• Contenus

• Méthodes d'enseignement et d'apprentissage

• Cours ex-cathedra
• Travaux de laboratoires

• Evaluation

• Bioinformatique Théorie et TP

  Examen Ecrit Evaluation Continue

• Langue(s) de l'unité d'enseignement

• Français

• Supports de cours au format papier

• Aucun support déposé pour cette unité d'enseignement

• Autres supports de cours

• Notes de Bioinformatique ( Centre ressource de l'école virtuelle)

  Anciaux Daniel